Выполнение скрипта, загруженного на страницу при помощи AJAX

Самый простой вариант - использовать eval(). Пусть data - некоторый контент, который мы загрузили.

// Прикрепляем контент к имеющейся DOM структуре:
var out = document.getElementById("content");        
out.innerHTML = data;

// Получаем все скрипты из загруженного контента:
var scripts = out.getElementsByTagName('script');

// Обходим все вставленные скрипты и инициируем их выполнение:
var len = scripts.length;
for (var i = 0; i < len; i++) {
  eval.call(window, scripts[i].innerHTML);  
}

Другой вариант - разделить загрузку javascript и html

Браузер не знает о том, что был добавлен некий javascript: консоль ошибок Firefox сообщает, что loadPage not defined. Надо загружать отдельно js и html и дать понять браузеру, что был загружен js. Т.е. надо создать объект <script> и внутрь этого объекта прописать ответ сервера (т.е. function loadPage() {...}). Тогда браузер сможет понять, что нечто, полученное с сервера - это исполняемый javascript.

Вот как это будет без использования библиотеки:

1.html

<html>
	<head>
	<title>...</title>
	<script type="text/javascript">
		window.onload = function() {
		  var xmlHttpScript = getXmlHttp();
		  xmlHttpScript.open('GET', '3.txt', true);
		  xmlHttpScript.onreadystatechange = function() {
			if (xmlHttpScript.readyState == 4) {
			  if(xmlHttpScript.status == 200) {
				var scr = document.createElement('script');
				scr.type = 'text/javascript';
				scr.text = xmlHttpScript.responseText;
				document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild(scr);
			  }
			}
		  }
		  xmlHttpScript.send(null);

		  var xmlHttpHtml = getXmlHttp();
		  xmlHttpHtml.open('GET', '2.html', true);
		  xmlHttpHtml.onreadystatechange = function() {
			if (xmlHttpHtml.readyState == 4) {
			  if(xmlHttpHtml.status == 200) {
				document.getElementById('myDiv').innerHTML = xmlHttpHtml.responseText;
			  }
			}
		  }
		  xmlHttpHtml.send(null);
		}

		function getXmlHttp(){
		  var xmlhttp;
		  try {
			xmlhttp = new ActiveXObject("Msxml2.XMLHTTP");
		  } catch (e) {
			try {
			  xmlhttp = new ActiveXObject("Microsoft.XMLHTTP");
			} catch (E) {
			  xmlhttp = false;
			}
		  }
		  if (!xmlhttp && typeof XMLHttpRequest!='undefined') {
			xmlhttp = new XMLHttpRequest();
		  }
		  return xmlhttp;
		}
	</script>
	</head>
	<body>
		<div id="myDiv"></div>
	</body>
</html>

2.html

<select onChange="loadPage()">
	<option value="1">1</option>
	<option value="2">2</option>
</select>

3.txt

function loadPage() {
  alert('Привет!');
}

И наконец, с использованием jQuery проблема решается автоматически:

1.html

<html>
	</head>
		<script type="text/javascript" src="/jquery.js"></script>
		<script type="text/javascript">
			$(document).ready(function() {
			  $('#myDiv').load('2.html');
			});
		</script>
	</head>
	<body>
		<div id="myDiv"></div>
	</body>
</html>

2.html

<script type="text/javascript">
	function loadPage() {
	  alert('Привет');
	}
</script>
<select onChange="loadPage()">
	<option value="1">1</option>
	<option value="2">2</option>
</select>

При использовании jQuery можно не разделять html и js - похоже, авторы библиотеки позаботились о том, чтобы при загрузке некого контента с сервера проверять его на предмет наличия js. И если js есть, выполнить.